Uchylenie indywidualnej interpretacji podatkowej nie ma wpływu na bieg terminu przedawnienia wniosku o nadpłatę - wyrok z 8 stycznia 2026 r., I FSK 240/23

W rozpoznawanej sprawie, mając na względzie prawomocny wyrok WSA w Warszawie uchylający niekorzystną dla podatnika interpretację indywidualną przepisów prawa podatkowego, w dniu 31 grudnia 2021 r. spółka złożyła wniosek o stwierdzenie i zwrot nadpłaty w podatku od towarów i usług, w tym za okresy od I kwartału do III kwartału 2015 r.

Uznając za zasadną odmowę wszczęcia postępowania podatkowego na podstawie art. 165a § 1 Ordynacji podatkowej, Dyrektor Izby Administracji Skarbowej wyjaśnił, że w przedmiotowej sprawie zobowiązania podatkowe w podatku od towarów i usług za I, II i III kwartał 2015 r. przedawniły się z dniem 31 grudnia 2020 r., co jest okolicznością bezsporną i niekwestionowaną przez podatnika. Zatem złożenie wniosku o stwierdzenie i zwrot nadpłaty po upływie terminu przedawnienia zobowiązań podatkowych było bezskuteczne i nie mogło doprowadzić do wszczęcia postępowania.

Gdyby skarżąca złożyła wniosek o stwierdzenie i zwrot nadpłaty w podatku od towarów i usług za I, II i III kwartał 2015 r. do dnia 31 grudnia 2020 r. byłby on procedowany zgodnie z przepisami Ordynacji podatkowej, a okoliczność zaskarżenia interpretacji indywidualnej do sądu administracyjnego nie miałaby żadnego znaczenia dla oceny skuteczności wszczęcia postępowania w przedmiocie stwierdzenia nadpłaty dotyczącego ww. zobowiązań podatkowych.

Oddalając skargę sąd pierwszej instancji uznał, że merytoryczne rozpatrzenie wniosku o stwierdzenie i zwrot nadpłaty w podatku VAT za I, II i III kwartał 2015 r., w sytuacji gdy wniosek ten został złożony po upływie terminu przedawnienia ww. zobowiązań podatkowych (31 grudnia 2021 r.), byłoby działaniem wbrew zasadzie legalizmu i skutkowało naruszeniem art. 79 § 2 w zw. art. 70 § 1 Ordynacji podatkowej.

Naczelny Sąd Administracyjny oddalając skargę kasacyjną spółki wyjaśnił, że uchylenie interpretacji indywidualnej w trybie kontroli sądowoadministracyjnej nie ma wpływu na bieg terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego, o którym mowa w art. 70 § 1 Ordynacji podatkowej.

Po upływie terminu przedawnienia nie ma możliwości kształtowania wysokości zobowiązania podatkowego, niezależnie od tego, czy miałoby to być korzystne dla organu podatkowego, czy dla podatnika.

A zatem okoliczność zaskarżenia interpretacji indywidualnej do sądu administracyjnego nie ma znaczenia dla oceny skuteczności wszczęcia postępowania w przedmiocie stwierdzenia nadpłaty.

W konsekwencji wniosek o stwierdzenie i zwrot nadpłaty podatnik może złożyć zanim upłynie termin przedawnienia zobowiązania podatkowego określony w art. 70 § 1 Ordynacji podatkowej, a po upływie tego terminu prawo to wygasa zgodnie z art. 79 § 2 ww. ustawy.

NSA